Kameralar her yerde! İzliyorlar, dinliyorlar, kaydediyorlar. Sizin hakkınızda her şeyi biliyorlar! Peki siz onlar hakkında ne biliyorsunuz? Gizemli bir iş adamı olan Mr. Finch, ileride işlenecek suçları önceden önlemeyi hedefleyen bir bilgisayar programı geliştirir. İlginç bir karaktere sahip bu milyoner işadamı elindeki programı hayata geçirebilmek için resmi kayıtlarda ölü olarak geçen Reese adlı eski bir CIA ajanıyla anlaşır. Kendi kaynakları ve teknolojisiyle Reese'in yetenekleri ve sezgilerini birleştiren Mr. Finch'in amacı gelecekte işlenecek olan suçları henüz suçlular eyleme geçmeden önlemektir.
Genç bir savcının sosyal güvenlik numarası geldiğinde, Reese ve Finch ilgilendikleri kişinin kurban mı yoksa fail mi olduğunu anlamak için birlikte çalışır.
Detektif Carter, Reese ve Finch ile olan son karşılaşmasının ardından kalanları toparlamaya çalışır. Makine bu sefer ikiliye bir yerine dört tane sosyal güvenlik numarası verir.
Makine, kardeşi henüz öldürülen genç Darren'ı bir sonraki hedef olarak tanımlar. Bu arada Finch, eski iş ortağının oğlunun Makine hakkında bilgi edinmeye çok yaklaştığı konusunda endişeleri artar.
Finch ve Reese, ikili bir hayat sürüyor gibi görünen bir kişinin peşine düşer. Ancak, çok geçmeden aynı sosyal güvenlik numarasına sahip farklı iki kişi olduğunu fark ederler.
Reese, bazı haydutlarından para çalan Leon'u kurtarmak için Finch'in Makine ile olan iletişim kurallarını çiğner. Sonrasında ise Makine'yi Finch'i bulmak için kullanacaktır.
Reese, yanlış tip insanlarla parti yapan Brezilyalı bir diplomatın kızının yeni koruması olur. Finch, kaçırılmasının ardından topluma yeniden uyum sağlamakta zorluklar yaşar.
Özel Ajan Donnelly, Reese ve diğer üç adamı Rikers Adası'nda gözaltında tutmaktadır. Finch'in yardımıyla Carter, Reese'in gözaltından çıkmasına yardım eder.
Finch ve Carter, Reese'i hâlâ Donnelly tarafından tutsak tutulduğu Riker'dan çıkarmaya çalışır. Bu arada, Fusco bir sonraki hedef üzerinde tek başına çalışır.
Finch ve Reese, Sırp katillerin görünen hedefi olan temizlikçi bir kadını korumak için bir otele gizlice girerler. Bu arada Carter, FBI'a katılma sürecine başlar.
Makine aniden altı numara verir ve bunlardan birinin ücra Owen Adası'nda bir yeri vardır. Tropikal bir fırtına nedeniyle Finch ve Reese, sekiz kişiyle birlikte orada sıkışıp kalırlar.
Finch, yükselen başkan yardımcısını izlemek için bir teknoloji şirketinde gizli göreve gider. Şirket, farklı bir şey için paravan olan ajanlarla dolu görünür.
Hiç kimse makinenin nerede olduğunu bilmemektedir.Fakat makine hem Finch hem Reese ve onların yeni ortakları olan Shaw ve Root ile de iletişim kurmaktadır.
Bir internet şirketinin sahibi sevdikleri kayıp insanları bulmak adına açtığı sitede insanların kişisel bilgilerini satmaktadır. Carter Beecher'ın katilini ararken yeni bir polisi eğitmek zorundadır.
Makine gizli takipçi olduğu şüphesine sahip olan Ian Murphy'nin numarasını verince Reese, Shaw ve Carter, Fusco ve Zoe'nın da yardımıyla olayı araştırırlar.
Tüm ekip, Carter'ın cinayetini aydınlatmaya çalışırken, Finch ekipten birinin HR ile olan savaşı durdurmak için fazla ileriye gitmiş olabileceğini farkeder.
Ölmek üzere olan adamı korumak üzereyken ekip bir çok düşmanı ile karşı karşıya gelir. Reese olmadan ekip düşmanları tarafından tuzağa düşürülmüşlerdir.
Bilinmeyen bir varlığın Makine'nin olacak büyük bir felakete dair büyük resmi görmesini engellemesi üzerine ekip büyük resmin parçalarını toplamak için beş farklı numaraya yönlendirilir.
Shaw, takip için uluslararası hırsızlardan oluşan bir ekibe katılır, ancak beklenmedik olaylar onu Samaritan tarafından tespit edilme tehlikesiyle karşı karşıya bırakır.
Reese, şüpheli eylemleri ve onun nedenlerini sorgulamasına neden olan yetenekli genç bir subayı gözlemek için New York Polis Akademisi eğitmeni olarak çalışmaya başlar.
Reese, hayatına yönelik potansiyel tehdidin onu hedefinin amansız takibinden caydırmasına izin vermeyi reddeden bir ödül avcısını korumalıdır. Finch ayrıca Hong Kong'da başlattığı planı harekete geçirmeye çalışır.
Reese ve Shaw Finch'i yakalamak için yarışırken Finch yalnızca Samaritanın değil aynı zamanda kendinin ve Makinenin de sonu olabilecek bir görevde maksimum güvenlikle bir hükümet tesisine sızmaya çalışacaktır.